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Text File  |  1995-03-04  |  1.8 KB  |  40 lines
  1. *****************************************************
  2. * Tissue inhibitors of metalloproteinases signature *
  3. *****************************************************
  4.  
  5. Tissue inhibitors of metalloproteinases (TIMP)  are a family of proteins [1,2,
  6. 3] that can form complexes with extracellular matrix metalloproteinases  (such
  7. as collagenases)  and irreversibly  inactivate them.   TIMP's  are proteins of
  8. about 200 amino acid residues, 12 of which are cysteines involved in disulfide
  9. bonds [4].    The  basic structure of such a type of inhibitor is shown in the
  10. following schematic representation:
  11.  
  12.           +-----------------------------+         +--------------+
  13.         **|**                           |         |              |
  14.         CxCxCxxxxxxxxxxxxxxxxxCxxxxxxxxxCxxxxxxxCxCxCxCxCxxxxxCxxCxxx
  15.         |   |                 |                 |   | | |     |
  16.         |   +-----------------|-----------------+   +-+ +-----+
  17.         +---------------------+
  18.  
  19. 'C': conserved cysteine involved in a disulfide bond.
  20. '*': position of the pattern.
  21.  
  22. As a signature pattern for TIMP's, we chose  the N-terminal extremity of these
  23. proteins, which includes three conserved cysteines.
  24.  
  25. -Consensus pattern: C-x-C-x-P-x-H-P-Q-x-A-F-C
  26.                     [The three C's are involved in disulfide bonds]
  27. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  28. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  29. -Last update: December 1992 / Text revised.
  30.  
  31. [ 1] Stetler-Stevenson W.G., Krutzsch H.C., Liotta L.A.
  32.      J. Biol. Chem. 264:17374-17378(1989).
  33. [ 2] Woessner J. Jr.
  34.      FASEB J. 5:2145-2154(1991).
  35. [ 3] Pavloff N., Staskus P.W., Kishanani N.S., Hawkes S.P.
  36.      J. Biol. Chem. 267:17321-17326(1992).
  37. [ 4] Williamson R.A., Martson F.A.O., Angal S., Koklitis P., Panico M.,
  38.      Morris H.R., Carne A.F., Smith B.J., Harris T.J.R., Freedman R.B.
  39.      Biochem. J. 268:267-274(1990).
  40.